公司組織之營利事業適用盈虧互抵時，虧損年度如有不計入所得額課稅之投資收益時，其虧損金額應先減除虧損年度之投資收益後，再以虧損之餘額，自本年度純益額中扣除。

財政部臺北國稅局表示，營利事業因被投資事業減資彌補虧損、合併、破產或清算等而發生投資損失，於辦理營利事業所得稅結算申報時，除須注意投資損失應以實現者方能申報外，尚須以歷次列報減資彌補虧損後之實際投資成本餘額，計算出資額折減金額，以免重複列報投資損失。